Este conflicto de presenta debido a que el río Magdalena transporta residuos y aguas negras desde la parte alta y media de la cuenca hasta su desembocadura. Esta situación se refleja en los altos índices de contaminación del río en la zona del municipio de Magangué, ya que la gestión inadecuada de los residuos en las áreas superiores de la cuenca contribuye a la degradación del río y afecta la calidad del agua para consumo y actividades productivas en este sector. La comunidad a menudo expresa que el país tiene una deuda con el caribe por ser receptores de los residuos del 70 % del país.